Estrutura básica da Secretaria do Desenvolvimento Econômico, Ciência e Tecnologia é composta pelos seguintes órgãos:

• Gabinete do Secretário
• Direção-Geral.
• DPCI - Departamento de Promoção Comercial e Assuntos Internacionais 
• DAPE - Departamento de Ações e Programas Especiais.
• DPI - Departamento de Promoção do Investimento e Sala do Investidor.
• DAMEPP - Departamento de Apoio à Microempresa e Empresa de Pequeno Porte.
• DA - Departamento Administrativo.
• DTUR - Departamento de Turismo.

• Chefia de Gabinete
• ASJUR - Assessoria Jurídica.
• ASCOM - Assessoria de Comunicação.
• ASTEC - Assessoria Técnica.
  
• SEADAP - Sistema Estadual para Atração e Desenvolvimento de Atividades Produtivas.